双指数和 Hyperlog™ 是方程，其特征是在反射点（通常为零）附近表现出伪线性行为值，并在远离反射点的值处转换为伪对数行为观点。这些方程通常用于在单个绘图上显示具有高动态范围（通常> 16 位）的流式细胞术数据。它们优于对数刻度，主要是因为以下特征：可以显示低于零的值以对数显示的图可以在流式细胞术（1024 个通道）中常用的图上展示显示伪影。在 Biexponential 和 Hyperlog 显示中很大程度上避免了这些伪影。双指数和 BD FACSDiva 软件展开

FACSDiva™ 软件允许您通过打开绘图检查器（查看 -> 检查器）并设置所需轴的复选框来查看双指数刻度上的参数显示为双指数，如下图所示。

默认情况下，FACSDiva 软件会自动计算反射点。 FACSDiva 使用专有算法来计算反射点（这不是 Parks 等人论文中建议的方法，请参阅下面的进一步阅读），以优化 BD 仪器生成的数据的双指数显示。 FACSDiva 软件不会告诉您它计算出的反射点，但它会告诉您es 告诉您\"低于零”的值。这个低于零的值可以被认为是在绘图上绘制的大约最低数据值（这并不完全正确，但是是一个足够接近的近似值）。需要注意的是，数据文件中可能有一些数据实际上并未绘制在绘图上。如果有一些外围事件比大部分人口的负面影响更大，则尤其如此。该算法旨在忽略这些事件，以便这些少数事件不会过度影响整个情节。如果不忽略它们，图表上可能会有大量区域专门用于几个单元格。

因此，需要重申的是，默认情况下，低于零的值可以从数据文件到数据文件。这意味着，即使两个图可能看起来相似，人们也可能必须仔细检查坐标轴，看看坐标轴之间是否存在很大差异。请参阅下面 Novo & Wood 撰写的论文，了解更详细的信息解释和示例。

可以通过打开 FACSDiva 软件中的双指数编辑器（查看 -> 双指数编辑器）来查看低于零的值，如下图所示。

请注意，已为数据文件中的每个参数自动计算低于零的值。您可以通过选择手动单选按钮并输入所需的值来自行输入低于零的值。如果您希望样本之间的轴缩放保持一致，您可以手动输入值。

默认情况下，\"零以下”是根据所有事件计算的，但是 FACSDiva 还允许您选择它所计算的总体将用于自动计算低于零的值。您可以通过右键单击图并选择按人口比例来选择此选项，然后选择所需的人口，如下图所示：

您可以在下面的两张图片中看到，\"按人口比例缩放”可以产生戏剧性的效果。将\"总体比例”设置为特定总体将产生尝试使该总体中最低数据聚类在紧邻轴的绘图区域中显示为聚类的效果。

在下面的左面板中，请注意 Y 轴上的最小值是 -6,011。这是因为有些事件（红框）比其他人群负面得多。大多数这些事件并不发生在 P1 人群中。通过将比例更改为基于 P1（右面板），零以下计算不会考虑 P1 之外的事件，其中包括红色框中的大多数事件。因此，低于零的值在 pa 中更为正（仅 -1,282）。nel 在右侧。

由于我们关闭与 BD 合作，FCS Express 现在支持 FACSDiva 在显示双指数数据方面的所有选项。事实上，我们已经实施了 FACSDiva 的专有算法来计算反射点，因此 FCS Express 的结果看起来与 FACSDiva 软件的结果相同。

FCS Express 支持多种缩放公式。< /p>

要设置绘图的缩放比例，请右键单击绘图，然后从出现的弹出菜单中选择\"格式”。

选择\"轴”类别，如下图所示。您可以为每个轴独立设置缩放比例，并从多种缩放公式中进行选择。 FCS Express 手册中详细解释了不同的公式。

每个缩放公式还具有与其关联的不同选项。当您在 FCS Express 中选择特定缩放时，这些选项将立即出现在缩放选择菜单下方。

Hyperlog 缩放方程只有一个可调整参数，对应于 Bagwell 论文中的 b 变量。该参数可以被认为是通道值，低于该值缩放主要呈现线性 behavior。

双指数选项更复杂，如下图所示。我们将详细描述每个属性。

某些数据文件，特别是在 BD FACSDiva 中收集的数据文件，在文件元数据中包含信息，以确定数据低于零的范围。

但是，可以根据需要自定义双指数缩放的属性。

选中自动复选框后，将根据数据中包含的元数据设置数据的负值范围。

取消选中\"自动”复选框时，绘图将使用\"格式”屏幕中的双指数选项来自定义数据显示。

如果您选择\"使用此值”单选按钮（如此图中所示），绘图将使用您输入的值（在图中，1000）。如果您希望绘图上的轴缩放比例在样本之间保持一致，则可以将选择固定的零以下值与修改绘图的最小分辨率结合使用。

FCS Express 7 的新增功能，滑动条允许您根据视觉偏好自定义负面程度，而不是通过输入数字。

只需向左或向右滑动滑块即可以一种或另一种方式调整该轴的负​​向程度。

如果您希望根据情况自动调整负向程度对于数据，您可以选择自动计算单选按钮。这将模仿 FACS 中的默认行为女主角。

当您选择自动计算时，您将获得两个额外的选择。

当您使用 FACSDiva 数据文件在 FCS Express 中打开绘图时，使用 FCS Express 的默认用户选项，数据显示将与您类似我们在 FACSDiva 中查看它 - 以线性、对数或双指数形式，并使用相同的双指数低于零值。

在大多数情况下，FCS Express 将使用之前从 FACSDiva 计算的值显示绘图。但是，如果您在 FACSDiva 中选择了人口比例，FCS Express 将无法匹配这些值，因为它们未存储在数据文件中。在这种情况下，您将能够使用上述格式选项重新创建其外观。

下图显示了 FACSDiva 数据的比较和FCS Express

缩放至 FACSDiva 中的所有事件缩放至基于 FACSDiva 中的 P1缩放至 FCS Express 中的所有事件缩放至基于 FCS Express 中的 P1FACSDiva 导入器展开

FCS Express 中的 BD FACSDiva 导入程序将从 FACSDiva 软件导入您的实验，并在 FCS Express 中重新创建类似的分析。更多信息可以在这里找到。在 FCS Express 版本 3.00.0800 之前，FACSDiva 中以双指数显示的图被导入为 FCS Express 中的 hyperlog。但是，当实验导入 FCS Express 时，3.00.0800 之后的版本将保留双指数缩放。 （要检查您的版本号，请从主菜单转到\"帮助”->\"关于”）。不幸的是，如果您在 FACSDiva 中选择了 Scale-To Population，FCS Express 将无法将上述\"with the gateway”选项设置为与 Scale-To Population 相同。这是因为 FACSDiva 导出的 XML 文件不包含所选规模的总体名称。您必须前往 FCS Express 中的绘图并自行选择正确的门。

进一步阅读展开

以下文章提供了比本网页中提供的更详细的信息：

关于流式细胞术中缩放显示的一般评论：Novo, D. & Wood, J (2008)。流式细胞术直方图：转换、分辨率和显示。细胞计数：73A：685-692。

Hyperlog 变换的详细描述：Bagwell, CB。 （2005）。 Hyperlog - 一种灵活的类似对数的变换，适用于负值、零值和正值数据。细胞计数法。 64: 34-42。

双指数变换的详细描述：Parks DR, Roederer M, Moore WA。 （2006）。新的\"Logicle”显示方法避免了低信号和补偿数据的对数缩放的欺骗性影响。细胞计数法。 69: 541-545

这些方程的关键可调参数是转变点，即方程在数据的哪个点从线性行为转变为对数行为。

< p>由于双指数显示是由 BD FACSDiva 软件普及的，因此我们将从这里开始讨论。

FACSDiva 是 Becton Dickinson Inc 的商标Hyperlog 是 Verity Software 的商标

标签：双指数、负、绘图、轴、轴

上一页什么是分辨率选项？下一页设置 FCS Express 以显示来自 FACSDiva 的 FCS 3.0 数据的最佳方法是什么4 个十年对数刻度？